RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 NUDT3O95989 172 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 NDUFB10O96000 172 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 GH1P01241 217 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 CALB1P05937 261 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 LPLP06858 475 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 CA4P22748 312 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 RRM1P23921 792 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 FOXN2P32314 431 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 CHKAP35790 457 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAP1GDS1P52306 607 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 JAK3P52333 1124 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAD23BP54727 409 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 LGALS4P56470 323 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARL4CP56559 192 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 PPP3CAQ08209 521 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 AP1B1Q10567 949 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMED2Q15363 201 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 CT83Q5H943 113 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 C1orf220Q5T0J3 134 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKS6Q68DC2 871 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 PRR5LQ6MZQ0 368 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 CGB2Q6NT52 195 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 C4orf50Q6ZRC1 276 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 OTUD6AQ7L8S5 288 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 JAZF1Q86VZ6 243 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 LONP2Q86WA8 852 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 C4orf19Q8IY42 314 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPICE1Q8N0Z3 855 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 DAW1Q8N136 415 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIF2BQ8N4N8 673 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 ALLCQ8N6M5 410 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 OR14C36Q8NHC7 312 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 C1orf54Q8WWF1 131 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF333Q96JL9 665 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 OLFM3Q96PB7 478 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 BTBD10Q9BSF8 475 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-55P-201ENST00000411092 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 MIS12Q9H081 205 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM96AQ9H5X1 160 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 SYNCQ9H7C4 482 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYP4F11Q9HBI6 524 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D22BQ9NU19 505 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-55P-201ENST00000411092 PARVAQ9NVD7 372 aa3.65□□□□□ -1.83
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