RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 TUBP50607 506 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 NAGLUP54802 743 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 POU6F1Q14863 301 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 FAM26DQ5JW98 314 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 KBTBD6Q86V97 674 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP18Q8N392 663 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 CASP10Q92851 521 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 FAR2Q96K12 515 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 MRGPRX2Q96LB1 330 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 FSD1LQ9BXM9 530 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 PDP2Q9P2J9 529 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 STK39Q9UEW8 545 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 CDYLQ9Y232 598 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 NOD1Q9Y239 953 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.02■■□□□ 1.44
PMS1-205ENST00000409985 HEATR9A2RTY3 570 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 TRPC5OSA6NMA1 111 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 MGEA5O60502 916 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 BAG2O95816 211 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 CHRNGP07510 517 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 PAX7P23759 505 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 CD52P31358 61 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 SLC14A2Q15849 920 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 IZUMO2Q6UXV1 221 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 MON1AQ86VX9 555 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 TMEM126BQ8IUX1 230 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 LSMEM2Q8N112 164 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 KYQ8NBH2 561 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 FBXO5Q9UKT4 447 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 SCML2Q9UQR0 700 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 TLR6Q9Y2C9 796 aa24.01■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 LOC100653049A0A140TA62 436 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8TH3BQL2 631 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 TADA2AO75478 443 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 KRT34O76011 436 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 CKBP12277 381 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 RENBPP51606 427 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 EPHB1P54762 984 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 MBTPS1Q14703 1052 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 KDELC1Q6UW63 502 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 SLC39A13Q96H72 371 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 TOX2Q96NM4 488 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 CLIC5Q9NZA1 410 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 XPR1Q9UBH6 696 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
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PMS1-205ENST00000409985 SLC26A3P40879 764 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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PMS1-205ENST00000409985 CDC16Q13042 620 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 OR52E8Q6IFG1 317 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 NEPROQ6NW34 567 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN17Q96FV3 270 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 TMEM209Q96SK2 561 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 HS3ST4Q9Y661 456 aa24■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 NEBLO76041 1014 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 RHOQP17081 205 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 SLC1A2P43004 574 aa23.99■■□□□ 1.43
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PMS1-205ENST00000409985 CEP97Q8IW35 865 aa23.99■■□□□ 1.43
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PMS1-205ENST00000409985 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 SLC26A7Q8TE54 656 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 UCMAQ8WVF2 138 aa23.99■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
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PMS1-205ENST00000409985 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 SLC12A2P55011 1212 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 MPP1Q00013 466 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 LPIN1Q14693 890 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 PDSS2Q86YH6 399 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 MFSD6LQ8IWD5 586 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 KDM1BQ8NB78 822 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 NXNL1Q96CM4 212 aa23.98■■□□□ 1.43
PMS1-205ENST00000409985 C8orf48Q96LL4 319 aa23.98■■□□□ 1.43
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