RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 FEM1CQ96JP0 617 aa15.57■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.57■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 MGME1Q9BQP7 344 aa15.57■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.56■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 NEMP1O14524 444 aa15.56■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 AP1B1Q10567 949 aa15.56■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 LGMNQ99538 433 aa15.56■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 HEMGNQ9BXL5 484 aa15.56■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GTW7 788 aa15.55■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.55■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 APOC2P02655 101 aa15.55■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.55■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 LATO43561 262 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SOCS5O75159 536 aa15.54■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV4-34P06331 123 aa15.54■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 CA4P22748 312 aa15.54■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 TAS2R38P59533 333 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP8P85298 464 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 XRCC4Q13426 336 aa15.54■□□□□ 0.08
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PGGT1B-202ENST00000379615 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 NPNTQ6UXI9 565 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 PGBD5Q8N414 524 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC13Q8NBP0 860 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 IL12RB2Q99665 862 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 SEMA3CQ99985 751 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 NOD2Q9HC29 1040 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 PARD6AQ9NPB6 346 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 FADS3Q9Y5Q0 445 aa15.54■□□□□ 0.08
PGGT1B-202ENST00000379615 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.53■□□□□ 0.08
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