RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PQM1 296 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 INAFM1C9JVW0 142 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFSF14O43557 240 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX30O94993 753 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 NTN1O95631 604 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 TFPIP10646 304 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT9P35527 623 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 MPP1Q00013 466 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 RUNX2Q13950 521 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 HNF4GQ14541 408 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 FSCBQ5H9T9 825 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 CES5AQ6NT32 575 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 TRILQ7L0X0 811 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 RFFLQ8WZ73 363 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 MPP4Q96JB8 637 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 MPP6Q9NZW5 540 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF69Q9UC07 566 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0U1RQF3 1178 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6C75A6NL08 312 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 HSPB2A8KAH6 182 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 VWA5AO00534 786 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 LDLRAD4O15165 306 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP2C2O75185 946 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 PCNAP12004 261 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 MYF6P23409 242 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 POU1F1P28069 291 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCD1P33897 745 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 ABATP80404 500 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 ADORA2A-AS1P86434 159 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 MYBPC2Q14324 1141 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 VEPH1Q14D04 833 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 HSPB2Q16082 182 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 ESCO2Q56NI9 601 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 TXNDC8Q6A555 127 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 GJC3Q8NFK1 279 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 SNAPC3Q92966 411 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL29Q96CT2 875 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 NUF2Q9BZD4 464 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 PLK2Q9NYY3 685 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPH5 198 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNL4K9M1U5 179 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF4O00268 1085 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ITM2AO43736 263 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 KLK8O60259 260 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CD4P01730 458 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CBSLP0DN79 551 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 UBL4AP11441 157 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 NAGAP17050 411 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC25AP30304 524 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CBSP35520 551 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 Q0VFX4 171 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 DCAF6Q58WW2 860 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 SAAL1Q96ER3 474 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 DCLK3Q9C098 648 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 EBF3Q9H4W6 596 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 FZD10Q9ULW2 581 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 A4GNTQ9UNA3 340 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 A3GALT2U3KPV4 340 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 B4E171 279 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGGTB-202ENST00000370826 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms