RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368632.6

HDAC2-201, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HDAC2, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-201ENST00000368632 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 ODC1P11926 461 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 22.6
HDAC2-201ENST00000368632 ETS2P15036 469 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 HOXC13P31276 330 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CHRNA4P43681 627 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SULT2A1Q06520 285 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CSHL1Q14406 222 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 SPATA24Q86W54 205 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 FAR2Q96K12 515 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CHST12Q9NRB3 414 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.33■□□□□ 0.85
HDAC2-201ENST00000368632 NEMP2A6NFY4 417 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 ARL5CA6NH57 179 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 HTR7P34969 479 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 SCNN1GP51170 649 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 NEPROQ6NW34 567 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 ADA2Q9NZK5 511 aa20.33■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 M0QZ92 97 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 HSPA13P48723 471 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 ZNF280DQ6N043 979 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 FAM171BQ6P995 826 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 METTL23Q86XA0 190 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 CCDC126Q96EE4 140 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 CNBD2Q96M20 576 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 MRGBPQ9NV56 204 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.32■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 AURKAO14965 403 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 PSME3P61289 254 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 PFKPQ01813 784 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 IRF5Q13568 498 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 MAPRE2Q15555 327 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 UPP1Q16831 310 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 MANEALQ5VSG8 457 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 RANBP10Q6VN20 620 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 CHSY3Q70JA7 882 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 BEND5Q7L4P6 421 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 NDNQ99608 321 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 ACBD6Q9BR61 282 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 CCR1P32246 355 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 STX5Q13190 355 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 SQLEQ14534 574 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 PSMD5Q16401 504 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 RNF135Q8IUD6 432 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 ASB9Q96DX5 294 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 OLFM1Q99784 485 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 A8MT66 165 aa20.3■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 CAPNS1P04632 268 aa20.3■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 HOXC8P31273 242 aa20.3■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 RPL5P46777 297 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 CLCN2P51788 898 aa20.3■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 LSAMPQ13449 338 aa20.3■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 PCSK7Q16549 785 aa20.3■□□□□ 0.84
HDAC2-201ENST00000368632 KLC3Q6P597 504 aa20.3■□□□□ 0.84
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