RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341472.9

SYNE2-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE2, Length 1,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE2-201ENST00000341472 ITIH2P19823 946 aa20.39■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.38■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 RARAP10276 462 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 CASP14P31944 242 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 ILKQ13418 452 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 FZD2Q14332 565 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 CFAP58Q5T655 872 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.36■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 CAPNS1P04632 268 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 JUPP14923 745 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 TCF4P15884 667 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 PFN3P60673 137 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 ELP6Q0PNE2 266 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 UGP2Q16851 508 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 PROX2Q3B8N5 592 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 BTBD6Q96KE9 485 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 KNTC1P50748 2209 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 PLXNA2O75051 1894 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 TSPAN11A1L157 253 aa20.35■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 CBFA2T2O43439 604 aa20.35■□□□□ 0.85
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SYNE2-201ENST00000341472 ALPPL2P10696 532 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 ERAP2Q6P179 960 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 OR4C6Q8NH72 309 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 TEKT4Q8WW24 435 aa20.35■□□□□ 0.85
SYNE2-201ENST00000341472 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.35■□□□□ 0.85
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