RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328834.9

CNOT10-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT10, Length 2,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-201ENST00000328834 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 NCSTNQ92542 709 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 KCNA7Q96RP8 456 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.97□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 CD4P01730 458 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 OR4Q2P0C623 313 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 CCDC166P0CW27 439 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 GALNT2Q10471 571 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 BNIPLQ7Z465 357 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 C14orf80Q86SX3 495 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 ALG9Q9H6U8 611 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CNOT10-201ENST00000328834 CABYRO75952 493 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 POMCP01189 267 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 MYL3P08590 195 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 SCNN1GP51170 649 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 APLP1P51693 650 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 IHHQ14623 411 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 DBN1Q16643 649 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 B3GALT6Q96L58 329 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 A0A1B0GTL3 188 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 CXCL11O14625 94 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 SLC5A2P31639 672 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 MAPK10P53779 464 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 REP15Q6BDI9 236 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 GPR152Q8TDT2 470 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 NUDT8Q8WV74 236 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 HDAC11Q96DB2 347 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 27.2
CNOT10-201ENST00000328834 KLHL33A6NCF5 533 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 ECT2LQ008S8 904 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 GPR158Q5T848 1215 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 MYLPFQ96A32 169 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 AURKCQ9UQB9 309 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 A8MT66 165 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 ASLP04424 464 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 PRDX6P30041 224 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 SCNN1BP51168 640 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 GALK1P51570 392 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 ARSDP51689 593 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 SLC7A2P52569 658 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 FOXA1P55317 472 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 PRPSAP1Q14558 356 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 CCL14Q16627 93 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 IFNEQ86WN2 208 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 MAML3Q96JK9 1138 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 CNDP1Q96KN2 507 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 BTBD9Q96Q07 612 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 KIFC1Q9BW19 673 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 RNF181Q9P0P0 153 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT10-201ENST00000328834 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms