RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 FYB2Q5VWT5 728 aa22.89■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.89■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.89■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 PRAMEF12O95522 483 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 PAMP19021 973 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 LIMK2P53671 638 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 GALNT3Q14435 633 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 FIBINQ8TAL6 211 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.88■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 TPP1O14773 563 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 CYBBP04839 570 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ETV4P43268 484 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 LMAN2Q12907 356 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 CNTN4Q8IWV2 1026 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 LHX3Q9UBR4 397 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 MROH6A6NGR9 719 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 NDST3O95803 873 aa22.87■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 PDE1BQ01064 536 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 PDK4Q16654 411 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ACMSDQ8TDX5 336 aa22.87■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.87■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 CHKBQ9Y259 395 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ZNF197O14709 1029 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 LDB2O43679 373 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 SIN3BO75182 1162 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 MT-CO1P00395 513 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 DHRS4L1P0CG22 281 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ALADP13716 330 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 CEBPBP17676 345 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 CD70P32970 193 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 CRHR1P34998 444 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ZNF77Q15935 545 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 DCLK2Q8N568 766 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.86■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 PBX4Q9BYU1 374 aa22.86■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 TLE6Q9H808 572 aa22.86■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.85■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 ACDQ96AP0 544 aa22.85■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ZMYND15Q9H091 742 aa22.85■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.85■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 GGT7Q9UJ14 662 aa22.85■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.85■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 TIMM44O43615 452 aa22.84■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.84■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 VPS11Q9H270 941 aa22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.84■■□□□ 1.25
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RNF170-201ENST00000240159 PRLP01236 227 aa22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 MAGEA12P43365 314 aa22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 NRIP1P48552 1158 aa22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 USP4Q13107 963 aa22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 DUSP6Q16828 381 aa22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RNF170-201ENST00000240159 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
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