RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ERFP50548 548 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PLIN5Q00G26 463 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BIKQ13323 160 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZNF621Q6ZSS3 439 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 STRADAQ7RTN6 431 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RBFAQ8N0V3 343 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GJD3Q8N144 294 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TEKT5Q96M29 485 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ADAM2Q99965 735 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TLR10Q9BXR5 811 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KLHL1Q9NR64 748 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TBL1XO60907 577 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SERPINB7O75635 380 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CAPN1P07384 714 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TPSB2P20231 275 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ACADLP28330 430 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GPR1P46091 355 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IRF8Q02556 426 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PTSQ03393 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TPSAB1Q15661 275 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 POTEHQ6S545 545 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PPTC7Q8NI37 304 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RIT1Q92963 219 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 VMP1Q96GC9 406 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LAG3P18627 525 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NFKB1P19838 968 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CRATP43155 626 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C21orf59P57076 290 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 WDR59Q6PJI9 974 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MPP4Q96JB8 637 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DUSP16Q9BY84 665 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RRAGCQ9HB90 399 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C3orf18Q9UK00 162 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.27□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GSAPA4D1B5 854 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ENDOD1O94919 500 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MYL9P24844 172 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DOK6Q6PKX4 331 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BBS12Q6ZW61 710 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FIBCD1Q8N539 461 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCDC33Q8N5R6 958 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CDRT15Q96T59 188 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ASB8Q9H765 288 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ETAA1Q9NY74 926 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 UBE2QL1A1L167 161 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 UGT2B11O75310 529 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MFN2O95140 757 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IFNGP01579 166 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PRDX6P30041 224 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MLH1P40692 756 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 STK32CQ86UX6 486 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CREG2Q8IUH2 290 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RTKNQ9BST9 563 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ALG9Q9H6U8 611 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms