RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 RIN3Q8TB24 985 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CD300AQ9UGN4 299 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 REP15Q6BDI9 236 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN14Q8NG11 270 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 LRTOMTQ8WZ04 291 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SLCO4A1Q96BD0 722 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 HEATR9A2RTY3 570 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 H3BSA7 217 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPA1O75762 1119 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PCSK6P29122 969 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC7A1P30825 629 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC1A2P43004 574 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 KLC3Q6P597 504 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 POTEHQ6S545 545 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 LPGAT1Q92604 370 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK4P11802 303 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNCP24863 283 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 RANBP1P43487 201 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH3B2P48448 385 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CD151P48509 253 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 RABGGTBP53611 331 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 POU4F1Q01851 419 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 POU6F1Q14863 301 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 NRF1Q16656 503 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 AK5Q9Y6K8 562 aa22.34■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ANXA9O76027 345 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 H6PDO95479 791 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 USP17L7P0C7H9 530 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PFKPQ01813 784 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 USP33Q8TEY7 942 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC126Q96EE4 140 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TREX1Q9NSU2 369 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1B0GTW7 788 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PRORSD1PA6NEY8 169 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMUO75648 421 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SMPD1P17405 629 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 NUP93Q8N1F7 819 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SGF29Q96ES7 293 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 PREBQ9HCU5 417 aa22.33■■□□□ 1.17
HTATSF1-201ENST00000218364 UBDO15205 165 aa22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ADRA1AP35348 466 aa22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 HACD2Q6Y1H2 254 aa22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM35AQ86V20 835 aa22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SULF1Q8IWU6 871 aa22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 IL12RB2Q99665 862 aa22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 GLOD4Q9HC38 313 aa22.33■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 NEMP2A6NFY4 417 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 H3BNH8 94 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM45BPQ6NSW5 357 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM45AQ8TCE6 357 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 C1QTNF8P60827 252 aa22.32■■□□□ 1.16
HTATSF1-201ENST00000218364 AGKQ53H12 422 aa22.32■■□□□ 1.16
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