RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 CRATP43155 626 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 C16orf62Q7Z3J2 963 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 OR10G6Q8NH81 332 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 FANCEQ9HB96 536 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 FCHO1O14526 889 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 NAA20P61599 178 aa20.36■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 NFATC1O95644 943 aa20.36■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 TAF13Q15543 124 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 AADACL2Q6P093 401 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.36■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 C16orf46Q6P387 395 aa20.35■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 RNF145Q96MT1 663 aa20.35■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 XKR6Q5GH73 641 aa20.35■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.34■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.34■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 KLHL35Q6PF15 583 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 SNX32Q86XE0 403 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 MAML3Q96JK9 1138 aa20.34■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 GDF3Q9NR23 364 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 ASF1AQ9Y294 204 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 RIPK3Q9Y572 518 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 CLUHO75153 1309 aa20.34■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 ITFG1Q8TB96 612 aa20.34■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 MAF1Q9H063 256 aa20.34■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 RNFT2Q96EX2 444 aa20.34■□□□□ 0.85
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CTDP1-208ENST00000613122 ITGAVP06756 1048 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 APOL4Q9BPW4 351 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 PEX1O43933 1283 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 EPORP19235 508 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 HNF4AP41235 474 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 IL17AQ16552 155 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-208ENST00000613122 LGMNQ99538 433 aa20.33■□□□□ 0.85
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