RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550233.1

TMEM116-211, Transcript of transmembrane protein 116, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene TMEM116, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116-211ENST00000550233 ACSM2BQ68CK6 577 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 RNF144BQ7Z419 303 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 KLBQ86Z14 1044 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 C10orf53Q8N6V4 93 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 LINC01465Q8N7H1 131 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 SPC24Q8NBT2 197 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 Q8NFD4 153 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 TSPAN14Q8NG11 270 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 MGARPQ8TDB4 240 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 HS6ST2Q96MM7 605 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 GPR78Q96P69 363 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 OR2A14Q96R47 310 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 IFT27Q9BW83 186 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 HRH4Q9H3N8 390 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 GRHL1Q9NZI5 618 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 WDR35Q9P2L0 1181 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 EPS15L1Q9UBC2 864 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 CARD8Q9Y2G2 431 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 ZNF536O15090 1300 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 WDR27A2RRH5 827 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 YY2O15391 372 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 MPPED1O15442 326 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FOXS1O43638 330 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 TPPPO94811 219 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 NDUFA10O95299 355 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 CBX6O95503 412 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 PCNAP12004 261 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 HLA-DPA1P20036 260 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 CIITAP33076 1130 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 F2RL1P55085 397 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 DDR1Q08345 913 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 GRAPQ13588 217 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FGFBP1Q14512 234 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 SLMAPQ14BN4 828 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 NAB2Q15742 525 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 MMEL1Q495T6 779 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 C5orf22Q49AR2 442 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 VSTM1Q6UX27 236 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 RTL10Q7L3V2 364 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 GLRX5Q86SX6 157 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 TEX9Q8N6V9 391 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 GDPD5Q8WTR4 605 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 HDAC11Q96DB2 347 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FBXL20Q96IG2 436 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 XYLT2Q9H1B5 865 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 PLK2Q9NYY3 685 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 PADI1Q9ULC6 663 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 CMAHPQ9Y471 501 aa4.99□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 PRYO14603 147 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 PEX1O43933 1283 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FMO6PO60774 539 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 DAB1O75553 588 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 PSMD10O75832 226 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 TUBBP07437 444 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 FCGR2AP12318 317 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 TNFRSF1AP19438 455 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 VPS41P49754 854 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 RAB28P51157 221 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 ZNF84P51523 738 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 ARSFP54793 590 aa4.98□□□□□ -1.61
TMEM116-211ENST00000550233 BLOC1S1P78537 153 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms