RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	HSPA4L	O95757	839 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	PEX11B	O96011	259 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	PGK1	P00558	417 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	LINGO3	P0C6S8	592 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	THRA	P10827	490 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ODC1	P11926	461 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	COX4I1	P13073	169 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	AKR1A1	P14550	325 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	CD1E	P15812	388 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	TFEB	P19484	476 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	TYMP	P19971	482 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ITGAX	P20702	1163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	CTGF	P29279	349 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	CRABP2	P29373	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	CDC25C	P30307	473 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	GPC1	P35052	558 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SERPINB6	P35237	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ABCG1	P45844	678 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	TUB	P50607	506 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	GEM	P55040	296 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	FAM189B	P81408	668 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	FOXK2	Q01167	660 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	CDH17	Q12864	832 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	DLG1	Q12959	904 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	CCNI	Q14094	377 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	RCN2	Q14257	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	LPIN1	Q14693	890 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	PPP2R5D	Q14738	602 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	FSCB	Q5H9T9	825 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	KDELC1	Q6UW63	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	USP33	Q8TEY7	942 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	RNF34	Q969K3	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	TADA1	Q96BN2	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SLC39A13	Q96H72	371 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	VPS39	Q96JC1	886 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SUSD3	Q96L08	255 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	UROC1	Q96N76	676 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	OR52B2	Q96RD2	323 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	RANBP9	Q96S59	729 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	RTKN	Q9BST9	563 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SIK2	Q9H0K1	926 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	NMUR1	Q9HB89	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	TREX1	Q9NSU2	369 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	OSER1	Q9NX31	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	FNIP2	Q9P278	1114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	MID2	Q9UJV3	735 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	VPS28	Q9UK41	221 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	TLK1	Q9UKI8	766 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	PADI3	Q9ULW8	664 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	SUFU	Q9UMX1	484 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IFT122-231	ENST00000514275	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms