RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CRYBG2Q8N1P7 616 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 CATSPER1Q8NEC5 780 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 LPCAT1Q8NF37 534 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP2S1Q96SQ9 504 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 CROTQ9UKG9 612 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TRPV2Q9Y5S1 764 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SBF2Q86WG5 1849 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 RREB1Q92766 1687 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 CABYRO75952 493 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 CRABP2P29373 138 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 LRPAP1P30533 357 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 ETV4P43268 484 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PSME3P61289 254 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP2K5Q13163 448 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PCLAFQ15004 111 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR158Q5T848 1215 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PKN3Q6P5Z2 889 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 MIER2Q8N344 545 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 MARCH2Q9P0N8 246 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SIRPGQ9P1W8 387 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PQH9 124 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SLCO1B7G3V0H7 640 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PRKCGP05129 697 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PHEXP78562 749 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 DSC2Q02487 901 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 INPP5AQ14642 412 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TBCELQ5QJ74 424 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 LGI2Q8N0V4 545 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM86AQ8N2M4 240 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 RAET1EQ8TD07 263 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 MPP4Q96JB8 637 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHAC1Q9H158 963 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCC13Q9NSE7 274 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 EVPLQ92817 2033 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 KNL1Q8NG31 2342 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 ARL5CA6NH57 179 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 AKR1A1P14550 325 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF23P17027 643 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 VCLP18206 1134 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TEKT5Q96M29 485 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TBATAQ96M53 351 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM15Q9C019 465 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 GBA3Q9H227 469 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXW11Q9UKB1 542 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PKP3Q9Y446 797 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 H0Y626 953 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 DPYSL4O14531 572 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM16O95361 564 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PARNO95453 639 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 AHSGP02765 367 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SERPINF2P08697 491 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 HARS2P49590 506 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PSEN1P49768 467 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PQLC1Q8N2U9 271 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB18Q99592 522 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PADI3Q9ULW8 664 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 DERAQ9Y315 318 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 F5H5T6 163 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC2A3P11169 496 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 MYL4P12829 197 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC5A3P53794 718 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 LBRQ14739 615 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM187BQ17R55 369 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 C6orf52Q5T4I8 152 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SPRYD7Q5W111 196 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 MBLAC2Q68D91 279 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 UBR7Q8N806 425 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 HEXDCQ8WVB3 486 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 GLT1D1Q96MS3 346 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SMOQ99835 787 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC39A3Q9BRY0 314 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC39A8Q9C0K1 460 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNK13Q9HB14 408 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 PIDD1Q9HB75 910 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 TBC1D13Q9NVG8 400 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 RHBDL2Q9NX52 303 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-211ENST00000503687 BTN3A1O00481 513 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms