RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 KRIT1O00522 736 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 UGT2B4P06133 528 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 GKP32189 559 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 HDAC4P56524 1084 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 PFN3P60673 137 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 VOPP1Q96AW1 172 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 VPS16Q9H269 839 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 GGT7Q9UJ14 662 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.89■■□□□ 1.26
TRDMT1-211ENST00000495022 AREL1O15033 823 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SPINT1O43278 529 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 AQP9O43315 295 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 KDELR3O43731 214 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 DXOO77932 396 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TPM2P07951 284 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT3P12035 628 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 KLK7P49862 253 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PTP4A2Q12974 167 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT31Q15323 416 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MYLK3Q32MK0 819 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 LSMEM2Q8N112 164 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC185Q8N715 623 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 IFI44Q8TCB0 444 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCG4Q9H172 646 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 KLF15Q9UIH9 416 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ITM2BQ9Y287 266 aa22.89■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 LRP4O75096 1905 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TPP1O14773 563 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CSO75390 466 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MYF5P13349 255 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 JUNDP17535 347 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TLE3Q04726 772 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PTK2BQ14289 1009 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SPACA3Q8IXA5 215 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF248Q8NDW4 579 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MAPK15Q8TD08 544 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CENPTQ96BT3 561 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.88■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 EPHB6O15197 1021 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 USP12O75317 370 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GJB6O95452 261 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 STAT1P42224 750 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 LSSP48449 732 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GABREP78334 506 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 RAD51Q06609 339 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 C3orf20Q8ND61 904 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 HIC2Q96JB3 615 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TBATAQ96M53 351 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.87■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 UNC13CQ8NB66 2214 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TOR1BO14657 336 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 BUB1O43683 1085 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TMCC1O94876 653 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MPOP05164 745 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CALB1P05937 261 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GPD1P21695 349 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 THOP1P52888 689 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ERVPABLB-1P60509 514 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR155Q7Z3F1 870 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 LMX1AQ8TE12 382 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC39A7Q92504 469 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 LGMNQ99538 433 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 IL12RB2Q99665 862 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms