RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 INSIG1O15503 277 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SOCS5O75159 536 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM63AO94886 807 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 AP2A1O95782 977 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 IGSF6O95976 241 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 IFNB1P01574 187 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HOXB2P14652 356 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TPSB2P20231 275 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ECHS1P30084 290 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FDFT1P37268 417 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MAGEA3P43357 314 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CXCL12P48061 93 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DGKEP52429 567 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RHOAP61586 193 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DSC2Q02487 901 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GAS6Q14393 721 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TPSAB1Q15661 275 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CARD16Q5EG05 197 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EMC10Q5UCC4 262 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZS52 159 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZVU0 165 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF534Q76KX8 674 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SYT13Q7L8C5 426 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CPT1BQ92523 772 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RUBCNQ92622 972 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SEMA3CQ99985 751 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NOD2Q9HC29 1040 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GDF3Q9NR23 364 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 WHRNQ9P202 907 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SUN2Q9UH99 717 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 C10orf142B7Z368 130 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CTIFO43310 598 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PI15O43692 258 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SIN3BO75182 1162 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PRLP01236 227 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EPOP01588 193 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EPHX1P07099 455 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CTSLP07711 333 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HLA-EP13747 358 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFRSF8P28908 595 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MAXP61244 160 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CDK16Q00536 496 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAF2Q12933 501 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GPS1Q13098 491 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MTAPQ13126 283 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MPP3Q13368 585 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP1R7Q15435 360 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ACCSLQ4AC99 568 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PID1Q7Z2X4 250 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SRLQ86TD4 932 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 HOOK3Q86VS8 718 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CHST14Q8NCH0 376 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MCUQ8NE86 351 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms