RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTPN9	P43378	593 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	PGF	P49763	221 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	VAV2	P52735	878 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZP2	Q05996	745 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	RING1	Q06587	406 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERINC3	Q13530	473 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	TDG	Q13569	410 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDGFRL	Q15198	375 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCDC14	Q49A88	953 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	XP32	Q5T750	250 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	PARM1	Q6UWI2	310 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	STRADA	Q7RTN6	431 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	JAML	Q86YT9	394 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	RFFL	Q8WZ73	363 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1orf74	Q96LT6	269 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC22A12	Q96S37	553 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	TBCB	Q99426	244 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPY6R	Q99463	290 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	CNPY3	Q9BT09	278 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	VCX3B	Q9H321	246 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	WDCP	Q9H6R7	721 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	BRD9	Q9H8M2	597 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	KCNK12	Q9HB15	430 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	NENF	Q9UMX5	172 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANHX	E9PGG2	379 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	CHAD	O15335	359 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZSCAN12	O43309	604 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRT86	O43790	486 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRPSAP2	O60256	369 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACSL4	O60488	711 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	MED26	O95402	600 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	NFATC1	O95644	943 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	LATS1	O95835	1130 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	AGR2	O95994	175 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	ASGR2	P07307	311 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	FCAR	P24071	287 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	S100A5	P33763	92 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	CHKA	P35790	457 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARHGAP25	P42331	645 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCZ1B	P86790	482 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	AMPD2	Q01433	879 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	HTR4	Q13639	388 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	MESD	Q14696	234 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP2R5D	Q14738	602 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	RCN1	Q15293	331 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF77	Q15935	545 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	BOLA3	Q53S33	107 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	ODF2	Q5BJF6	829 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL31	Q6EBC2	164 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	VIT	Q6UXI7	678 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRRC31	Q6UY01	552 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	USP51	Q70EK9	711 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	HTR3D	Q70Z44	454 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZAR1	Q86SH2	424 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM139	Q8IV31	216 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	DENND1C	Q8IV53	801 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	CPA6	Q8N4T0	437 aa		6.33	□□□□□ -1.4

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