RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 GREM1O60565 184 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FGF18O76093 207 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CNTN5O94779 1100 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 JCHAINP01591 159 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 F13BP05160 661 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CCNB1P14635 433 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TACR2P21452 398 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 STX2P32856 288 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ADRA1AP35348 466 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SOX11P35716 441 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ALDH1A3P47895 512 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ATP1A2P50993 1020 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 KCNQ1P51787 676 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 GNGT1P63211 74 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 GUCY1A3Q02108 690 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FPGSQ05932 587 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 DMTNQ08495 405 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PLD1Q13393 1074 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 NAB1Q13506 487 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MPP2Q14168 576 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PARP15Q460N3 678 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ALFQ53S48 1182 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC31Q6UY01 552 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM135Q86UB9 458 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MPP5Q8N3R9 675 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FIBCD1Q8N539 461 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 GLMNQ92990 594 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TTC17Q96AE7 1141 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 YME1L1Q96TA2 773 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PAFAH2Q99487 392 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RAD9AQ99638 391 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 EPN3Q9H201 632 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MPP6Q9NZW5 540 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 INSL6Q9Y581 213 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.13□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM120BA0PK00 339 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEB16A2A368 324 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RASA4BC9J798 803 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 AP3B1O00203 1094 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 RASA4O43374 803 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TGM5O43548 720 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TYROBPO43914 113 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 ANXA9O76027 345 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 STC2O76061 302 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CPP00450 1065 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 GHRHP01286 108 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 KLKB1P03952 638 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CHN1P15882 459 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 CREB1P16220 341 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PFKLP17858 780 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 PGAM1P18669 254 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SLC6A4P31645 630 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 BMPR1AP36894 532 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 MSH2P43246 934 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 NPY2RP49146 381 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SLC11A2P49281 568 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 EPHB3P54753 998 aa6.12□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 SLC18A2Q05940 514 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms