RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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PITX3-201ENST00000370002 AREL1O15033 823 aa20.59■□□□□ 0.89
PITX3-201ENST00000370002 DAPK3O43293 454 aa20.59■□□□□ 0.89
PITX3-201ENST00000370002 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PITX3-201ENST00000370002 PRAMEF11O60813 436 aa20.59■□□□□ 0.89
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PITX3-201ENST00000370002 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.56■□□□□ 0.88
PITX3-201ENST00000370002 Q6ZSR6 202 aa20.56■□□□□ 0.88
PITX3-201ENST00000370002 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.56■□□□□ 0.88
PITX3-201ENST00000370002 EID2Q8N6I1 236 aa20.56■□□□□ 0.88
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PITX3-201ENST00000370002 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.56■□□□□ 0.88
PITX3-201ENST00000370002 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.56■□□□□ 0.88
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