RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 LIG3P49916 1009 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 PIPSLA2A3N6 862 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 KLK10O43240 276 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 B4GALT3O60512 393 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BEST1O76090 585 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LRIG2O94898 1065 aa4.49□□□□□ -1.69
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