RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 TBC1D3EA0A087X179 549 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TBC1D3LB9A6J9 549 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FAM72CH0Y354 149 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 MAGEC1O60732 1142 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 LRIG2O94898 1065 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 MT-CO3P00414 261 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TBC1D3HP0C7X1 549 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PTMSP20962 102 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 L1CAMP32004 1257 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PPP2CBP62714 309 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PPP2CAP67775 309 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RHDQ02161 417 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 GNA12Q03113 381 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CDO1Q16878 200 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ACCSLQ4AC99 568 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 Q6ZVU0 165 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FAM72BQ86X60 149 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SLC25A45Q8N413 288 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 MAGEH1Q9H213 219 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DMTF1Q9Y222 760 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FAM170AA1A519 330 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ANKRD62A6NC57 917 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 LRRC53A6NM62 1247 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TRIM38O00635 465 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SIGLEC6O43699 453 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 GJB6O95452 261 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CD160O95971 181 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PRNPP04156 253 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TNFAIP3P21580 790 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RRM1P23921 792 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CHRNA3P32297 505 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PBX1P40424 430 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 UCNP55089 124 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TMPRSS3P57727 454 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CNTN1Q12860 1018 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 AGBL4Q5VU57 503 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 NEK5Q6P3R8 708 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 TRIM69Q86WT6 500 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CCDC185Q8N715 623 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 OR7D4Q8NG98 312 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 LGMNQ99538 433 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 PARVAQ9NVD7 372 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 A0A1W2PQJ5 194 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SYCE3A1L190 88 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 WASH4PA8MWX3 477 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 K7ERQ8 282 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CCP110O43303 1012 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 RTN2O75298 545 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 CTSLP07711 333 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 GIMD1P0DJR0 217 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 HTR7P34969 479 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 NUMBP49757 651 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 METAP1P53582 386 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ERVPABLB-1P60509 514 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ARF5P84085 180 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 MAMLD1Q13495 774 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 STAT4Q14765 748 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 C22orf39Q6P5X5 142 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 LSMEM2Q8N112 164 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 OR4C6Q8NH72 309 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-221ENST00000550734 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.1 ms