RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	RASA4B	C9J798	803 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ARHGAP33	O14559	1287 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SCAMP1	O15126	338 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	RASA4	O43374	803 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	HR	O43593	1189 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ADAM23	O75077	832 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	LRCH4	O75427	683 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PALM	O75781	387 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	NDUFA10	O95299	355 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	FTCD	O95954	541 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	IL2RA	P01589	272 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	GABRG2	P18507	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PTGER3	P43115	390 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PTPN9	P43378	593 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	GABRB2	P47870	512 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	KRT72	Q14CN4	511 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM215	Q68D42	235 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	LAYN	Q6UX15	382 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SYT13	Q7L8C5	426 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	LONP2	Q86WA8	852 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	CLDN23	Q96B33	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	HMCES	Q96FZ2	354 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	P2RY11	Q96G91	374 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846		H7C0C1	242 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	AGRP	O00253	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	TIMM44	O43615	452 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PRKCG	P05129	697 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	MAGEA9	P43362	315 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ATP5O	P48047	213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	MAX	P61244	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PTP4A2	Q12974	167 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	GAB4	Q2WGN9	574 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SARM1	Q6SZW1	724 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	TTC7B	Q86TV6	843 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SCML4	Q8N228	414 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	BBS5	Q8N3I7	341 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	CHST14	Q8NCH0	376 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	RFFL	Q8WZ73	363 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	NUP205	Q92621	2012 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PI4KA	P42356	2102 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PATE3	B3GLJ2	98 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ALG1L2	C9J202	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846		I6L893	689 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	KCNK3	O14649	394 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ASL	P04424	464 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	CD48	P09326	243 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	CISD3	P0C7P0	127 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	KRT10	P13645	584 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PRLR	P16471	622 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	RHOQ	P17081	205 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	COMT	P21964	271 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	TAS2R40	P59535	323 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	SULT2A1	Q06520	285 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF33A	Q06730	810 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	AP1B1	Q10567	949 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	NNT	Q13423	1086 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	BOLA3	Q53S33	107 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLVS1-205	ENST00000519846	PEX26	Q7Z412	305 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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