RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519474.5

HDAC3-215, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 736 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-215ENST00000519474 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC3-215ENST00000519474 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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HDAC3-215ENST00000519474 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.5□□□□□ -0.89
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HDAC3-215ENST00000519474 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.49□□□□□ -0.89
HDAC3-215ENST00000519474 IGLON5A6NGN9 336 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC3-215ENST00000519474 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC3-215ENST00000519474 KRIT1O00522 736 aa9.48□□□□□ -0.89
HDAC3-215ENST00000519474 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDAC3-215ENST00000519474 DAPK3O43293 454 aa9.48□□□□□ -0.89
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