RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM63AO94886 807 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDK4P11802 303 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 GGT5P36269 586 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 AVPR1AP37288 418 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAFAH1B1P43034 410 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR12P47775 334 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SELENOVP59797 346 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFNB1P98172 346 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 TDGQ13569 410 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF667Q5HYK9 610 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPHA10Q5JZY3 1008 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM69AQ5T7M9 428 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM81Q6P7N7 255 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC22A25Q6T423 547 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 PARM1Q6UWI2 310 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 MOB3CQ70IA8 216 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHD1LQ86WJ1 897 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 HORMAD2Q8N7B1 307 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRC57Q8N9N7 239 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 NFKBIDQ8NI38 313 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 GDPD5Q8WTR4 605 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMCESQ96FZ2 354 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP44Q9H0E7 712 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 MVB12BQ9H7P6 319 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 POT1Q9NUX5 634 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 BABAM1Q9NWV8 329 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCND2Q9NZV8 630 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF521Q96K83 1311 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A096LPK6 155 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPTLC2O15270 562 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNFSF14O43557 240 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SH3BP5O60239 455 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD4P01730 458 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 HEXAP06865 529 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMP3P08254 477 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBL4AP11441 157 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARSBP15848 533 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPN2P17706 415 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHRNB2P17787 502 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTPS1P17812 591 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNLYP22749 145 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTGER1P34995 402 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT9P35527 623 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 CXCR3P49682 368 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTGR1Q14914 329 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 EDRF1Q3B7T1 1238 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 TADA2BQ86TJ2 420 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIM3Q86V86 326 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM160B2Q86V87 743 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 CADM3Q8N126 398 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASSF8Q8NHQ8 419 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEP76Q8TAP6 659 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNAPC3Q92966 411 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC25A28Q96A46 364 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 C7orf26Q96N11 449 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBA5Q9GZZ9 404 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 ISCUQ9H1K1 167 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 BRF2Q9HAW0 419 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 MPP6Q9NZW5 540 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIAA1456Q9P272 454 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 F5H0A9 414 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 I6L893 689 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TACC1O75410 805 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 MBD4O95243 580 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLDN7O95471 211 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 GALTP07902 379 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSG1P11464 419 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOXB2P14652 356 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNFAIP3P21580 790 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 FMO4P31512 558 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCTDP32321 178 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCD1P33897 745 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 RXRGP48443 463 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms