RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496305.5

PHF20-215, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 4

Gene PHF20, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-215	ENST00000496305	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	CNTROB	Q8N137	903 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	EME1	Q96AY2	570 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TASP1	Q9H6P5	420 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	LRRC53	A6NM62	1247 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ADAM10	O14672	748 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	PCNA	P12004	261 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	PTPN2	P17706	415 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	PTGER1	P34995	402 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	MMP13	P45452	471 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	MAMLD1	Q13495	774 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	CCNG2	Q16589	344 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	NGEF	Q8N5V2	710 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	SMARCE1	Q969G3	411 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	SCGB1D1	O95968	90 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	NFKBIA	P25963	317 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	BSG	P35613	385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ERV3-1	Q14264	604 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	PPP2R5B	Q15173	497 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	RNF183	Q96D59	192 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TRMO	Q9BU70	441 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	DECR2	Q9NUI1	292 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	SWAP70	Q9UH65	585 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	HSPB6	O14558	160 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	MMP3	P08254	477 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	MYZAP	P0CAP1	466 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	CHRNB1	P11230	501 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TNFSF8	P32971	234 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	GABRB2	P47870	512 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	GNAQ	P50148	359 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305		Q4G0T1	1027 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	MTX3	Q5HYI7	312 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	CDC73	Q6P1J9	531 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TRIM74	Q86UV6	250 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	TRIM73	Q86UV7	250 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ADSSL1	Q8N142	457 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	PDILT	Q8N807	584 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PHF20-215	ENST00000496305	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41

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