RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 NHLH1Q02575 133 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 BFSP1Q12934 665 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PEX6Q13608 980 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MBTPS1Q14703 1052 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZCWPW2Q504Y3 356 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR16Q569H4 304 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TTMPQ5BVD1 217 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 EFCAB12Q6NXP0 572 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PAOXQ6QHF9 649 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF410Q86VK4 478 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TCAIMQ8N3R3 496 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GJA10Q969M2 543 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 EME1Q96AY2 570 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FAR2Q96K12 515 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RIT2Q99578 217 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MYL10Q9BUA6 226 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 S100A14Q9HCY8 104 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GIN1Q9NXP7 522 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MTMR6Q9Y217 621 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ESYT2A0FGR8 921 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TISP43B9A030 160 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 B9A039 149 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 AREL1O15033 823 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PMM2O15305 246 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IRAK2O43187 625 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ALX3O95076 343 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 OPN1MWP04001 364 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT16P08779 473 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKCAP17252 672 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC9A1P19634 815 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FECHP22830 423 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXC8P31273 242 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PHKA2P46019 1235 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 BCAP31P51572 246 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF75DP51815 510 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MFAP3P55082 362 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MEA1Q16626 185 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL6Q8TCB7 284 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.676e-7■□□□□ 11
RABGGTB-213ENST00000496055 EXT2Q93063 718 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 OSMRQ99650 979 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM245Q9H330 911 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 BARHL2Q9NY43 387 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PTTG2Q9NZH5 202 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 EXTL2Q9UBQ6 330 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJB4Q9UDY4 337 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS28Q9UK41 221 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PSME2Q9UL46 239 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HCN2Q9UL51 889 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB23Q9ULC3 237 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 COQ6Q9Y2Z9 468 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MEIS1O00470 390 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IL6P05231 212 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CALB1P05937 261 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT5P13647 590 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGALP20701 1170 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PON1P27169 355 aa4.64□□□□□ -1.67
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