RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SYN3	O14994	580 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	IRAK2	O43187	625 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ITM2A	O43736	263 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CACNG3	O60359	315 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	OPHN1	O60890	802 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PAGE1	O75459	146 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SOAT2	O75908	522 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	OAZ2	O95190	189 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CBX6	O95503	412 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP6V1G2	O95670	118 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	JCHAIN	P01591	159 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ODC1	P11926	461 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNB1	P14635	433 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	EPCAM	P16422	314 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TYMP	P19971	482 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PAX3	P23760	479 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	NMBR	P28336	390 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PCSK1	P29120	753 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXC13	P31276	330 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MAGEA12	P43365	314 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CSRP3	P50461	194 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TPI1	P60174	286 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	OCRL	Q01968	901 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TFF2	Q03403	129 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	BST1	Q10588	318 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	GAS6	Q14393	721 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CRYM	Q14894	314 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MROH9	Q5TGP6	573 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	AFMID	Q63HM1	303 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CYS1	Q717R9	158 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PID1	Q7Z2X4	250 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MAVS	Q7Z434	540 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC7B	Q86TV6	843 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	METTL23	Q86XA0	190 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF511	Q8NB15	262 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNY	Q8ND76	341 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	HDAC11	Q96DB2	347 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ERP27	Q96DN0	273 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	AGAP3	Q96P47	875 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TSGA13	Q96PP4	275 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM237	Q96Q45	408 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	AGAP2	Q99490	1192 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MIPEP	Q99797	713 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	UBP1	Q9NZI7	540 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP10	Q9P2G4	905 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	HAO1	Q9UJM8	370 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	IRAK3	Q9Y616	596 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		5.91	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC78	A2IDD5	438 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	COPE	O14579	308 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TPP1	O14773	563 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CAPN9	O14815	690 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TGM5	O43548	720 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D4	O60343	1298 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	AP2A1	O95782	977 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PEX11B	O96011	259 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	IL1B	P01584	269 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ADH1A	P07327	375 aa		5.9	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	BPGM	P07738	259 aa		5.9	□□□□□ -1.46

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