RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DLG3Q92796 817 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FAM136AQ96C01 138 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SUSD3Q96L08 255 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 AGAP3Q96P47 875 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 BTBD9Q96Q07 612 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 GAD1Q99259 594 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 Q9H521 79 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 COG4Q9H9E3 785 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 S100A14Q9HCY8 104 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 COX16Q9P0S2 106 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PSAT1Q9Y617 370 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FAM72CH0Y354 149 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 HCRTO43612 131 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ATP9BO43861 1147 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TADA2AO75478 443 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KRT36O76013 467 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PRKCGP05129 697 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TFEBP19484 476 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ADRA1AP35348 466 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CD151P48509 253 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CLCN5P51795 746 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MTTPP55157 894 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CRADDP78560 199 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KLF10Q13118 480 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 STX5Q13190 355 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ITGA7Q13683 1181 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SLC14A2Q15849 920 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FAM26DQ5JW98 314 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MANEALQ5VSG8 457 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 AFMIDQ63HM1 303 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ANO7Q6IWH7 933 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RANBP10Q6VN20 620 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FAM72BQ86X60 149 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KYQ8NBH2 561 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RIN3Q8TB24 985 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TOP1MTQ969P6 601 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MYLPFQ96A32 169 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 C8orf48Q96LL4 319 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PKMYT1Q99640 499 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 EBF4Q9BQW3 602 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TASP1Q9H6P5 420 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PNPOQ9NVS9 261 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 STK39Q9UEW8 545 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SUFUQ9UMX1 484 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NOD1Q9Y239 953 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 HTTP42858 3142 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DYTNA2CJ06 578 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CCDC85CA6NKD9 419 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms