RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 PLPP6Q8IY26 295 aa22.88■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.88■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.88■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 SLC25A45Q8N413 288 aa22.88■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 TSC1Q92574 1164 aa22.88■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 GGT7Q9UJ14 662 aa22.88■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.88■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 RAD51BO15315 384 aa22.87■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 CREB3O43889 395 aa22.87■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 AKT2P31751 481 aa22.87■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 ACADVLP49748 655 aa22.87■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 EFHC2Q5JST6 749 aa22.87■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.87■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 CNPY3Q9BT09 278 aa22.87■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.87■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 TRABD2BA6NFA1 517 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC53A6NM62 1247 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 KRIT1O00522 736 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 TRIM38O00635 465 aa22.86■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 HMCESQ96FZ2 354 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 CALN1Q9BXU9 219 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 UCKL1Q9NWZ5 548 aa22.86■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 ITM2BQ9Y287 266 aa22.86■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 POM121BA6NF01 834 aa22.85■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 BUB1O43683 1085 aa22.85■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 RFPL3O75679 317 aa22.85■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 TMCC1O94876 653 aa22.85■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 UGT2B4P06133 528 aa22.85■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.85■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.85■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 APC2O95996 2303 aa22.84■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 RASA4O43374 803 aa22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 AP1G1O43747 822 aa22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC172P0C7W6 258 aa22.84■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 Q6ZSR6 202 aa22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 TMC6Q7Z403 805 aa22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.84■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 GPR27Q9NS67 375 aa22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 LAMA5O15230 3695 aa22.84■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 IGLON5A6NGN9 336 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 WASH4PA8MWX3 477 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 SIGLEC6O43699 453 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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KDELR3-202ENST00000409006 ITIH2P19823 946 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 CA9Q16790 459 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 PROX2Q3B8N5 592 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 TMPRSS12Q86WS5 348 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 EPAS1Q99814 870 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 TRIM7Q9C029 511 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.83■■□□□ 1.25
KDELR3-202ENST00000409006 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa22.83■■□□□ 1.24
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