RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384569.1

SNORD56.6-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.6-201ENST00000384569 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 RETSATQ6NUM9 610 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 POTEHQ6S545 545 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 PACS1Q6VY07 963 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 BHMTQ93088 406 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 RMDN1Q96DB5 314 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 MYO19Q96H55 970 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 MAGEB18Q96M61 343 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 RBBP8Q99708 897 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 SEMA3CQ99985 751 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 MGME1Q9BQP7 344 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 LMAN2LQ9H0V9 348 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCDC134Q9H6E4 229 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 IL21Q9HBE4 155 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 PDFQ9HBH1 243 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 MLXIPLQ9NP71 852 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 MKS1Q9NXB0 559 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 MSRAQ9UJ68 235 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 E2F8A0AVK6 867 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCDC78A2IDD5 438 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 GMNCA6NCL1 334 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 SOBPA7XYQ1 873 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 TPP1O14773 563 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 KDELR3O43731 214 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CACNG3O60359 315 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 LILRB3O75022 631 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ABCB7O75027 752 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ALDH1A2O94788 518 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMCC1O94876 653 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CRTAMO95727 393 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 RHOP08100 348 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ITGA2BP08514 1039 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 POU2F2P09086 479 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 LINC00271P0C7V0 271 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CES1P23141 567 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ADRA1DP25100 572 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 NFKBIAP25963 317 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 HADHAP40939 763 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCNFP41002 786 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CSKP41240 450 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCT5P48643 541 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 SGSHP51688 502 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 LIMK2P53671 638 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC18A1P54219 525 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ERVFC1P60507 584 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 AP1S1P61966 158 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 TNK2Q07912 1038 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 USP4Q13107 963 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 DNAJC3Q13217 504 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 OLIG2Q13516 323 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 GALNT3Q14435 633 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 TEAD2Q15562 447 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM182AQ5T1J6 154 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 GRTP1Q5TC63 336 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 MROH9Q5TGP6 573 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 KDELC1Q6UW63 502 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CES3Q6UWW8 571 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 Q6ZNB5 142 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 RAPH1Q70E73 1250 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 GAREM2Q75VX8 874 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 BBS7Q8IWZ6 715 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CYP4X1Q8N118 509 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 TEX26Q8N6G2 289 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CNTD1Q8N815 330 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.54□□□□□ -1.52
SNORD56.6-201ENST00000384569 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms