RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290378.4

ACTC1-201, Transcript of actin, alpha, cardiac muscle 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTC1, Length 4,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1-201ENST00000290378 PARVBQ9HBI1 364 aa11.14□□□□□ -0.63
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ACTC1-201ENST00000290378 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ACTC1-201ENST00000290378 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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ACTC1-201ENST00000290378 BAIAP3O94812 1187 aa11.13□□□□□ -0.63
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ACTC1-201ENST00000290378 CSHL1Q14406 222 aa11.13□□□□□ -0.63
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ACTC1-201ENST00000290378 ZNF410Q86VK4 478 aa11.13□□□□□ -0.63
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ACTC1-201ENST00000290378 SYT11Q9BT88 431 aa11.13□□□□□ -0.63
ACTC1-201ENST00000290378 EHD1Q9H4M9 534 aa11.13□□□□□ -0.63
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ACTC1-201ENST00000290378 VNN1O95497 513 aa11.12□□□□□ -0.63
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ACTC1-201ENST00000290378 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
ACTC1-201ENST00000290378 MYBPC1Q00872 1141 aa11.12□□□□□ -0.63
ACTC1-201ENST00000290378 TAP1Q03518 808 aa11.12□□□□□ -0.63
ACTC1-201ENST00000290378 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
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ACTC1-201ENST00000290378 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.12□□□□□ -0.63
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