RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 GJB6O95452 261 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 POP4O95707 220 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 GSRP00390 522 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ALPPL2P10696 532 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 GPD1P21695 349 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 HDAC4P56524 1084 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SGCGQ13326 291 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FAM72BQ86X60 149 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RFFLQ8WZ73 363 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 BMFQ96LC9 184 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 UCKL1Q9NWZ5 548 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 MYLKQ15746 1914 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 NEMP1O14524 444 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.025e-7■□□□□ 9.7
NEDD8-201ENST00000250495 RTP5Q14D33 572 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 WDR59Q6PJI9 974 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC185Q8N715 623 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 C3orf20Q8ND61 904 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ANO10Q9NW15 660 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD62A6NC57 917 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 KRIT1O00522 736 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FPGTO14772 594 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FFAR2O15552 330 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 KDELR3O43731 214 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RABIFP47224 123 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 UBXN1Q04323 297 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 RAD51Q06609 339 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 FGL2Q14314 439 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 MYLK3Q32MK0 819 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ASB12Q8WXK4 309 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 DUSP23Q9BVJ7 150 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 NLGN3Q9NZ94 848 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 ATRXP46100 2492 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD8-201ENST00000250495 POM121BA6NF01 834 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 IGLON5A6NGN9 336 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 SCAMP1O15126 338 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 BUB1O43683 1085 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CKMT1AP12532 417 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 MYL5Q02045 173 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 SEMG2Q02383 582 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 TMC6Q7Z403 805 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 AGPAT1Q99943 283 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 GPR27Q9NS67 375 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 NEU3Q9UQ49 428 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 LGALS16A8MUM7 142 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 H3BM21 787 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 RAD51BO15315 384 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 MT-CO3P00414 261 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CSF2P04141 144 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 UGT2B4P06133 528 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC172P0C7W6 258 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 GIMD1P0DJR0 217 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 GKP32189 559 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF542PQ5EBM4 170 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 EFHC2Q5JST6 749 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD8-201ENST00000250495 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.38■■□□□ 1.01
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