RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CCNC	P24863	283 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	NDE1	Q9NXR1	346 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	XPR1	Q9UBH6	696 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PQH9	124 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	AURKA	O14965	403 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ARNT	P27540	789 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	GCK	P35557	465 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	MAX	P61244	160 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	NXN	Q6DKJ4	435 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TRIB2	Q92519	343 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	MARK4	Q96L34	752 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BRF1-222	ENST00000635152	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	AIM2	O14862	343 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ANXA9	O76027	345 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV3-25	P01717	112 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ASGR1	P07306	291 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	COX4I1	P13073	169 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ITGAX	P20702	1163 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ITK	Q08881	620 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MGAT3	Q09327	533 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	KLF10	Q13118	480 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TUSC3	Q13454	348 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DDR2	Q16832	855 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MATN3	O15232	486 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	B4GALT3	O60512	393 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MYL4	P12829	197 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SLC1A2	P43004	574 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GPR15	P49685	360 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CRHR2	Q13324	411 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SLC12A1	Q13621	1099 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LIPM	Q5VYY2	423 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM198	Q66K66	360 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FAM136A	Q96C01	138 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FCRL5	Q96RD9	977 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	NDN	Q99608	321 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ACOT9	Q9Y305	439 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152		E9PAM4	449 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CYP11A1	P05108	521 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	STMN1	P16949	149 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TFEB	P19484	476 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LPIN1	Q14693	890 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29

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