RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CFLAR	O15519	480 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TIMM44	O43615	452 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PIGN	O95427	931 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	GABRB3	P28472	473 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ITK	Q08881	620 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TBCC	Q15814	346 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SUN2	Q9UH99	717 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	PAGE1	O75459	146 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CA8	P35219	290 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	UPP1	Q16831	310 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CCL22	O00626	93 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MGEA5	O60502	916 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	NPY2R	P49146	381 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	MAX	P61244	160 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ASPH	Q12797	758 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SMTN-222	ENST00000612341	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	AURKA	O14965	403 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	MTSS1	O43312	755 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	MPO	P05164	745 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ODC1	P11926	461 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	COX4I1	P13073	169 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ITGAX	P20702	1163 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	NUDT2	P50583	147 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ANO4	Q32M45	955 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	NDN	Q99608	321 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	XPR1	Q9UBH6	696 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341		F8W8V4	182 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	CASP10	Q92851	521 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341		C9IYK1	514 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	HCAR3	P49019	387 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	CDK7	P50613	346 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	PLK1	P53350	603 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	SLC5A3	P53794	718 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	AIF1	P55008	147 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	GJA9	P57773	515 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	KLF10	Q13118	480 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	RNF220	Q5VTB9	566 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SMTN-222	ENST00000612341	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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