RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 NPAS2Q99743 824 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SNX25Q9H3E2 840 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CAB39LQ9H9S4 337 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SPAG4Q9NPE6 437 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 PICK1Q9NRD5 415 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SETD4Q9NVD3 440 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CD300AQ9UGN4 299 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 TRHDEQ9UKU6 1024 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 BLOC1S6Q9UL45 172 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 WDR37Q9Y2I8 494 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 E2F8A0AVK6 867 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 TK2O00142 265 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 PTPRAP18433 802 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CYP2B6P20813 491 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 MATKP42679 507 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 NAGLUP54802 743 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 NME5P56597 212 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CBX3Q13185 183 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 GRM3Q14832 879 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 DLG2Q15700 870 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 NRF1Q16656 503 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 AMHR2Q16671 573 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SLC25A52Q3SY17 297 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SPATS1Q496A3 300 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 TMEM198Q66K66 360 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 REP15Q6BDI9 236 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ISLR2Q6UXK2 745 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ERMP1Q7Z2K6 904 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 BNIPLQ7Z465 357 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 RNF148Q8N7C7 305 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 C12orf29Q8N999 325 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 LPGAT1Q92604 370 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 TMIGD2Q96BF3 282 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ISOC1Q96CN7 298 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SCYL1Q96KG9 808 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 WRNIP1Q96S55 665 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 AGAP2Q99490 1192 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 VAT1Q99536 393 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 TRIM15Q9C019 465 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 GBA3Q9H227 469 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ZNF236Q9UL36 1845 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 A0A1B0GTW7 788 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 TMEM221A6NGB7 291 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 TRIM64BA6NI03 449 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 AQP12BA6NM10 295 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 KCNU1A8MYU2 1149 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 E7ENX8 843 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 DCLK1O15075 740 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 DLX3O60479 287 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 PORP16435 677 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 PTPN3P26045 913 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SULT1E1P49888 294 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 FSTL1Q12841 308 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SOWAHAQ2M3V2 549 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 MTX3Q5HYI7 312 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 GK5Q6ZS86 529 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ACOT1Q86TX2 421 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ERO1BQ86YB8 467 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CNTN4Q8IWV2 1026 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 AQP12AQ8IXF9 295 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ITPKCQ96DU7 683 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 CCDC126Q96EE4 140 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 COX4I2Q96KJ9 171 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 SLC25A23Q9BV35 468 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-202ENST00000542324 B3GNT5Q9BYG0 378 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 169.1 ms