RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514901.5

NUP54-216, Transcript of nucleoporin 54, humanhuman

TSL 3

Gene NUP54, Length 500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54-216ENST00000514901 BBS5Q8N3I7 341 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 KRT35Q92764 455 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 FATE1Q969F0 183 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 OMDQ99983 421 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 SGK2Q9HBY8 427 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 SEPT3Q9UH03 358 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 IL36AQ9UHA7 158 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 INVSQ9Y283 1065 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 EML5Q05BV3 1969 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 MID1O15344 667 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 MFSD11O43934 449 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 MAFKO60675 156 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 NDUFS2O75306 463 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 IGSF6O95976 241 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CCNCP24863 283 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PSMD8P48556 350 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PEX5P50542 639 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 RHOAP61586 193 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 ZNF33AQ06730 810 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 GRM3Q14832 879 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 MYLK3Q32MK0 819 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PLK5Q496M5 336 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PLD5Q8N7P1 536 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 GANCQ8TET4 914 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 FAM122AQ96E09 287 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 TSGA13Q96PP4 275 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 FZD4Q9ULV1 537 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.5□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 FAM186AA6NE01 2351 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 SLC7A4O43246 635 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 ZSCAN12O43309 604 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 TGM2P21980 687 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CSNK1DP48730 415 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 GBE1Q04446 702 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PDK1Q15118 436 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 ARSIQ5FYB1 569 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CACUL1Q86Y37 369 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 TP53INP2Q8IXH6 220 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 NETO2Q8NC67 525 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CHST14Q8NCH0 376 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 FOXJ1Q92949 421 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PSKH2Q96QS6 385 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 DYRK4Q9NR20 520 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 DTLQ9NZJ0 730 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.49□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 THADAQ6YHU6 1953 aa14.48□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.48□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 A0A1W2PP55 124 aa14.48□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 MATN3O15232 486 aa14.48□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CST8O60676 142 aa14.48□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 LEFTY1O75610 366 aa14.48□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 FTCDO95954 541 aa14.48□□□□□ -0.09
NUP54-216ENST00000514901 CTSLP07711 333 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms