RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 HEPHQ9BQS7 1158 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 IL36AQ9UHA7 158 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 PPM1HQ9ULR3 514 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 BNIP3LO60238 219 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 RHOBTB1O94844 696 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 POP4O95707 220 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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SH3BP2-212ENST00000508338 SLC8A1P32418 973 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 MARCKSL1P49006 195 aa27.27■■□□□ 1.96
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SH3BP2-212ENST00000508338 ELF2Q15723 593 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 HDAC11Q96DB2 347 aa27.27■■□□□ 1.96
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SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1R16AQ96I34 528 aa27.27■■□□□ 1.96
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SH3BP2-212ENST00000508338 DTLQ9NZJ0 730 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 FZD4Q9ULV1 537 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP3K13O43283 966 aa27.26■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 MAPK8P45983 427 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 CSNK1DP48730 415 aa27.26■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 LEKR1Q6ZMV7 388 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC6A17Q9H1V8 727 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 AMACRQ9UHK6 382 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 HEY1Q9Y5J3 304 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 SPAG17Q6Q759 2223 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC7A4O43246 635 aa27.25■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 PSMD8P48556 350 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF235Q14590 738 aa27.25■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa27.25■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 MYLK3Q32MK0 819 aa27.24■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 MARC1Q5VT66 337 aa27.24■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 TP53INP2Q8IXH6 220 aa27.24■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 P3H4Q92791 437 aa27.24■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 FBXL12Q9NXK8 326 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 SHROOM3Q8TF72 1996 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 MATN3O15232 486 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT10P13645 584 aa27.23■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 PRR23BQ6ZRT6 265 aa27.23■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 RLN3Q8WXF3 142 aa27.23■■□□□ 1.95
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SH3BP2-212ENST00000508338 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 LMNAP02545 664 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 DPP6P42658 865 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 DYNLT1P63172 113 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-212ENST00000508338 MEI1Q5TIA1 1274 aa27.22■■□□□ 1.95
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