RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TM4SF5O14894 197 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC7A4O43246 635 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 LEFTY1O75610 366 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SYPP08247 313 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM253P0C7T8 217 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 RARAP10276 462 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CD27P26842 260 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 HCAR3P49019 387 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF75DP51815 510 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 NDST2P52849 883 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 DPYSL2Q16555 572 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 UAP1L1Q3KQV9 507 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TC2NQ8N9U0 490 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 NETO2Q8NC67 525 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TEKT4Q8WW24 435 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ARRDC3Q96B67 414 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 HEPHQ9BQS7 1158 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ORAI3Q9BRQ5 295 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC39A8Q9C0K1 460 aa17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 DOCK9Q9BZ29 2069 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 C10orf142B7Z368 130 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 H3BRJ5 948 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TMCC1O94876 653 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SSR1P43307 286 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 GRIK2Q13002 908 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 DPYSQ14117 519 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ERMP1Q7Z2K6 904 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CPNE8Q86YQ8 564 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PLPP6Q8IY26 295 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OR2I1PQ8NGU4 316 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OR6K2Q8NGY2 324 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 KDM4CQ9H3R0 1056 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 EBF2Q9HAK2 575 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TM9SF3Q9HD45 589 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 DYRK4Q9NR20 520 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM131Q92545 1883 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A1W2PPC4 97 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 J3KR12 359 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PROSCO94903 275 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 GSRP00390 522 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 GKP32189 559 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ARL4AP40617 200 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CCR5P51681 352 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 TAS2R38P59533 333 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP2CBP62714 309 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP2CAP67775 309 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 HADHQ16836 314 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 AFMIDQ63HM1 303 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 POLNQ7Z5Q5 900 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 MINDY1Q8N5J2 469 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 NPWQ8N729 165 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OR2AP1Q8NGE2 309 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDH18Q9HCL0 1135 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 OSGEPQ9NPF4 335 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 A0A1B0GVT2 93 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGAP42A6NI28 874 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 DFFAO00273 331 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 KRIT1O00522 736 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 AMPD1P23109 780 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 BNC1Q01954 994 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC15Q0P6D6 951 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CYTH1Q15438 398 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 MYLK3Q32MK0 819 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC35G2Q8TBE7 412 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP1R16AQ96I34 528 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 CSPG4P5Q96PW8 444 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 HDAC8Q9BY41 377 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 PDFQ9HBH1 243 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 ETNK2Q9NVF9 386 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-205ENST00000496887 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms