RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ACCSLQ4AC99 568 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 SDE2Q6IQ49 451 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 CNTD1Q8N815 330 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 MGME1Q9BQP7 344 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 USP29Q9HBJ7 922 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 SUN2Q9UH99 717 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 PRR33A8MZF0 331 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 H7C0C1 242 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CR2P20023 1033 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 MMP13P45452 471 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ATP5OP48047 213 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 RENBPP51606 427 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 DGKEP52429 567 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 COPAP53621 1224 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CCNG2Q16589 344 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 MARC1Q5VT66 337 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 FAM129BQ96TA1 746 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 K7ESF4 209 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 MTSS1O43312 755 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 HLA-DQB2P05538 268 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 PTPN3P26045 913 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 RBL1P28749 1068 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 AVPR2P30518 371 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 RHOAP61586 193 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ZNF235Q14590 738 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 STARD3Q14849 445 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CYP1B1Q16678 543 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CARD16Q5EG05 197 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 STK40Q8N2I9 435 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 EXOC2Q96KP1 924 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 AMACRQ9UHK6 382 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 RNF103O00237 685 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 GJB3O75712 270 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 JCHAINP01591 159 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 TDGF1P13385 188 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CSNK1DP48730 415 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CCR3P51677 355 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 NRLP54845 237 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CHST14Q8NCH0 376 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 OR2T3Q8NH03 318 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 RTP4Q96DX8 246 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CEP41Q9BYV8 373 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 FBRSQ9HAH7 460 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.831e-15■□□□□ 9.1
ACTB-210ENST00000477812 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ALOX15BO15296 676 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 ITGAVP06756 1048 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CTSLP07711 333 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 GABRG2P18507 467 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 CXCL12P48061 93 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 GDF10P55107 478 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 IHHQ14623 411 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 TEX44Q53QW1 395 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 TEKT5Q96M29 485 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 HHIPQ96QV1 700 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 VAT1Q99536 393 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 NT5MQ9NPB1 228 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-210ENST00000477812 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms