RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	PARP15	Q460N3	678 aa		29.83	■■■□□ 2.37
FBXO18-208	ENST00000470089	RFX8	Q6ZV50	586 aa		29.83	■■■□□ 2.37
FBXO18-208	ENST00000470089	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
FBXO18-208	ENST00000470089	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		29.83	■■■□□ 2.37
FBXO18-208	ENST00000470089	HSPH1	Q92598	858 aa		29.83	■■■□□ 2.37
FBXO18-208	ENST00000470089	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
FBXO18-208	ENST00000470089	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		29.83	■■■□□ 2.37
FBXO18-208	ENST00000470089	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		29.83	■■■□□ 2.37
FBXO18-208	ENST00000470089	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC7A4	O43246	635 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	AKR1B10	O60218	316 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	BNC1	Q01954	994 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SERINC3	Q13530	473 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	RBSN	Q9H1K0	784 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	DYRK4	Q9NR20	520 aa		29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM131	Q92545	1883 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A1W2PPC4	97 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	TMCC1	O94876	653 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ERCC2	P18074	760 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	GK	P32189	559 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	CCR5	P51681	352 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC6A18	Q96N87	628 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC19	Q9H756	370 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		29.81	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	C10orf142	B7Z368	130 aa		29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	MYO1F	O00160	1098 aa		29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	OPHN1	O60890	802 aa		29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	NDST2	P52849	883 aa		29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	TAS2R38	P59533	333 aa		29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	DONSON	Q9NYP3	566 aa		29.8	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	RARA	P10276	462 aa		29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	TEAD4	Q15561	434 aa		29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	BOLA3	Q53S33	107 aa		29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	CNGA4	Q8IV77	575 aa		29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		29.79	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089		J3KR12	359 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNK5	O95279	499 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	GSR	P00390	522 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	DPYSL2	Q16555	572 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	H2AFV	Q71UI9	128 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	NPW	Q8N729	165 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC42	Q96M95	316 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	IL21R	Q9HBE5	538 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	KNL1	Q8NG31	2342 aa		29.78	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089		H3BRJ5	948 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	KRIT1	O00522	736 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	WNT9A	O14904	365 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	GIPC1	O14908	333 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	GRIA4	P48058	902 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	HCAR3	P49019	387 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	FOXK2	Q01167	660 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	DPYS	Q14117	519 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF19	Q2TAC6	998 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	PLPP6	Q8IY26	295 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	GAREM1	Q9H706	876 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		29.77	■■■□□ 2.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		29.76	■■■□□ 2.35

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