RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 RAB21Q9UL25 225 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 DOCK8Q8NF50 2099 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 KCNK1O00180 336 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 IFNB1P01574 187 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SRFP11831 508 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 IL9P15248 144 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TPSB2P20231 275 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GRIA2P42262 883 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TNFRSF4P43489 277 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MMP13P45452 471 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ECT2LQ008S8 904 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GUCY2DQ02846 1103 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SLC10A7Q0GE19 358 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TDGQ13569 410 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MORF4L2Q15014 288 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CYTH1Q15438 398 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TPSAB1Q15661 275 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MBLAC2Q68D91 279 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PID1Q7Z2X4 250 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 C12orf40Q86WS4 652 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC33Q8N5R6 958 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ART4Q93070 314 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MGME1Q9BQP7 344 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 C10orf88Q9H8K7 445 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GLOD4Q9HC38 313 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ASIC3Q9UHC3 531 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CBX4O00257 560 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ATP9BO43861 1147 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SUN1O94901 812 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 HLA-DQB2P05538 268 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RHOXF2BP0C7M4 288 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ETS1P14921 441 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CR2P20023 1033 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GLDCP23378 1020 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ADCY8P40145 1251 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SLC7A5Q01650 507 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZP2Q05996 745 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GPS1Q13098 491 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PRPSAP1Q14558 356 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 KCNJ11Q14654 390 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GEN1Q17RS7 908 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM215Q68D42 235 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 PPIL6Q8IXY8 311 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NAT16Q8N8M0 369 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TERB1Q8NA31 727 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MCUQ8NE86 351 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC110Q8TBZ0 833 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 BHMTQ93088 406 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 RHOXF2Q9BQY4 288 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 EPB41L5Q9HCM4 733 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 VPS45Q9NRW7 570 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ELOVL2Q9NXB9 296 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SEPT10Q9P0V9 454 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 AP3B1O00203 1094 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TP73O15350 636 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SNAP91O60641 907 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 ANXA9O76027 345 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 TMCC1O94876 653 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 METTL18O95568 372 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 GSRP00390 522 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 SRCP12931 536 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-202ENST00000317118 MAPK8P45983 427 aa5.99□□□□□ -1.45
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