RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	INPP4B	O15327	924 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	AHCYL1	O43865	530 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ATG7	O95352	703 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MPO	P05164	745 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CIB1	Q99828	191 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	EGFL8	Q99944	293 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM149A	A5PLN7	773 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM72C	H0Y354	149 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	RHOBTB1	O94844	696 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LRIG2	O94898	1065 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	OR6B1	O95007	311 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	UQCRB	P14927	111 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CHRM3	P20309	590 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM72B	Q86X60	149 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	B3GALT6	Q96L58	329 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	BTRC	Q9Y297	605 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	HDC	P19113	662 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NFKBIA	P25963	317 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPN3	P26045	913 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PSEN1	P49768	467 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CDK7	P50613	346 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PFKFB4	Q16877	469 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NDUFS3	O75489	264 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	APOA4	P06727	396 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	THOP1	P52888	689 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LILRA4	P59901	499 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PSME3	P61289	254 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	BTAF1	O14981	1849 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525		F8W8V4	182 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CXCL11	O14625	94 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NRP1	O14786	923 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	BEST1	O76090	585 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	F9	P00740	461 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF23	P17027	643 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGB6	P18564	788 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PRKCH	P24723	683 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MTX3	Q5HYI7	312 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TLK2	Q86UE8	772 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	APBB2	Q92870	758 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	RBBP8	Q99708	897 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	HAUS8	Q9BT25	410 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FETUB	Q9UGM5	382 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJA2	O60884	412 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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