RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636331.1

LINC00854-216, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene LINC00854, Length 718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854-216ENST00000636331 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.78□□□□□ -0.04
LINC00854-216ENST00000636331 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa14.78□□□□□ -0.04
LINC00854-216ENST00000636331 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.78□□□□□ -0.04
LINC00854-216ENST00000636331 GGT7Q9UJ14 662 aa14.78□□□□□ -0.04
LINC00854-216ENST00000636331 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.77□□□□□ -0.04
LINC00854-216ENST00000636331 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 PIAS2O75928 621 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 MPOP05164 745 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 PTMSP20962 102 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 NOS2P35228 1153 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 CXCR3P49682 368 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 DAB2P98082 770 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 TLE3Q04726 772 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 TMEM259Q4ZIN3 620 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ARSIQ5FYB1 569 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 HORMAD1Q86X24 394 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 OR6K2Q8NGY2 324 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 OR4C6Q8NH72 309 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 SYNCQ9H7C4 482 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ITM2BQ9Y287 266 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.77□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 POM121BA6NF01 834 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 LEFTY1O75610 366 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 PCDH8O95206 1070 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 MBD3O95983 291 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 MT-CO3P00414 261 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 GKP32189 559 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 OXCT1P55809 520 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 OVGP1Q12889 678 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ILKQ13418 452 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 TAF3Q5VWG9 929 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 SLC39A7Q92504 469 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 KLF15Q9UIH9 416 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.76□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 SPINT1O43278 529 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ZMPSTE24O75844 475 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ABL2P42684 1182 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ARF5P84085 180 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 PTK2Q05397 1052 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 DEUP1Q05D60 604 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 FAM131BQ86XD5 332 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 XYLT1Q86Y38 959 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 DRC7Q8IY82 874 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 NT5C3BQ969T7 300 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 VOPP1Q96AW1 172 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 BMFQ96LC9 184 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 APOLD1Q96LR9 279 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 WDCPQ9H6R7 721 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 GPR27Q9NS67 375 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 IL36AQ9UHA7 158 aa14.75□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 OPA1O60313 960 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 MAGEC1O60732 1142 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 SRGAP2O75044 1071 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 CD160O95971 181 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 CDK4P11802 303 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 OR1E1P30953 314 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 AKT2P31751 481 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 KRT9P35527 623 aa14.74□□□□□ -0.05
LINC00854-216ENST00000636331 NUDT1P36639 197 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms