RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	MACC1	Q6ZN28	852 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	FSCN2	O14926	492 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SH3BGRL	O75368	114 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SLITRK3	O94933	977 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CYBB	P04839	570 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CXCL8	P10145	99 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CREB1	P16220	341 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ERCC2	P18074	760 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	NFIA	Q12857	509 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	PFKFB4	Q16877	469 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	NCAM2	O15394	837 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	PEX2	P28328	305 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	TNK2	Q07912	1038 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	STX4	Q12846	297 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	TPK1	Q9H3S4	243 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ALOX15B	O15296	676 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP2C9	P11712	490 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	S100A3	P33764	101 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	RTP1	P59025	263 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	EDEM1	Q92611	657 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A087WZ62	844 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	BTN3A3	O00478	584 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	DPYSL4	O14531	572 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ENTPD3	O75355	529 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	AVIL	O75366	819 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	QPRT	Q15274	297 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	VPS72	Q15906	364 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ALG9	Q9H6U8	611 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	MBD2	Q9UBB5	411 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM50B	Q9Y247	325 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	EML1	O00423	815 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	STAG3L1	P0CL83	205 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ITGAX	P20702	1163 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC5A3	P53794	718 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	WDR49	Q8IV35	697 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CERS2	Q96G23	380 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	BTN3A1	O00481	513 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	HAT1	O14929	419 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	SERPINA1	P01009	418 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	ALOX5	P09917	674 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC166	P0CW27	439 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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