RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 TSTD1Q8NFU3 115 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 OR2T3Q8NH03 318 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 OLFM3Q96PB7 478 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 HHIPQ96QV1 700 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 FAM129BQ96TA1 746 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 CARD9Q9H257 536 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa17.98■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 KCNK3O14649 394 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 ALDH1A2O94788 518 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 TMCC1O94876 653 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 GABRG2P18507 467 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 COPAP53621 1224 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF33AQ06730 810 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 PDK1Q15118 436 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 ANGPT1Q15389 498 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 C22orf39Q6P5X5 142 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 TSSK4Q6SA08 328 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 Q6ZVU0 165 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 OR2A12Q8NGT7 310 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 P3H4Q92791 437 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 NELL1Q92832 810 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 HDAC11Q96DB2 347 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 ERLEC1Q96DZ1 483 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 BRD8Q9H0E9 1235 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 FBRSQ9HAH7 460 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 SP110Q9HB58 689 aa17.97■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 ENC1O14682 589 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 MCF2LO15068 1137 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 MATN3O15232 486 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 APOC2P02655 101 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 SLC10A7Q0GE19 358 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF528Q3MIS6 628 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 CARD16Q5EG05 197 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 TMPRSS6Q8IU80 811 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 STK40Q8N2I9 435 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 TEX26Q8N6G2 289 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 MAML1Q92585 1016 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 MRGPRX1Q96LB2 322 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 LGMNQ99538 433 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 PRRX2Q99811 253 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 TNKS2Q9H2K2 1166 aa17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ZNF548-204ENST00000594693 KMT2EQ8IZD2 1858 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 ALOX15BO15296 676 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 GSRP00390 522 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 SP9P0CG40 484 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 NDUFV2P19404 249 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 GNG11P61952 73 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 DMWDQ09019 674 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 LBRQ14739 615 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 TMCO4Q5TGY1 634 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 ANO7Q6IWH7 933 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 CCNYQ8ND76 341 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 MDGA1Q8NFP4 955 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 LRRN4Q8WUT4 740 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 HMGB4Q8WW32 186 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 LHX3Q9UBR4 397 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 PPM1HQ9ULR3 514 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF318Q5VUA4 2279 aa17.95■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 PXNP49023 591 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 RENBPP51606 427 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 NRLP54845 237 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 RPS14P62263 151 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 XRCC4Q13426 336 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 MYLK3Q32MK0 819 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 SEL1L2Q5TEA6 688 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 MARC1Q5VT66 337 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC13Q8IYE1 715 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 OR2AP1Q8NGE2 309 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 ACTL9Q8TC94 416 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 NSMCE1Q8WV22 266 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 VOPP1Q96AW1 172 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC114Q96M63 670 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 PSKH2Q96QS6 385 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 WDR24Q96S15 920 aa17.94■□□□□ 0.46
ZNF548-204ENST00000594693 SLC6A17Q9H1V8 727 aa17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms