RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-215ENST00000592578 SHBQ15464 509 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 C5orf22Q49AR2 442 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 NAA35Q5VZE5 725 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 LRRC31Q6UY01 552 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 PTPRN2Q92932 1015 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 TBCBQ99426 244 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 FZD4Q9ULV1 537 aa14.63□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 A0A1W2PP55 124 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 MID1O15344 667 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ADCY5O95622 1261 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 C5AR1P21730 350 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 SLC8A1P32418 973 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 NUDT1P36639 197 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 GGCXP38435 758 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 STAT1P42224 750 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 KLK7P49862 253 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 NXPH1P58417 271 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 BNIP3Q12983 259 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 C2CD6Q53TS8 623 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 XKR5Q6UX68 686 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ARCQ7LC44 396 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 C14orf80Q86SX3 495 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 STK40Q8N2I9 435 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ALG14Q96F25 216 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 C1orf74Q96LT6 269 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 FAM129BQ96TA1 746 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ABCG4Q9H172 646 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 VPS28Q9UK41 221 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.62□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 FAM170AA1A519 330 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 LGALS16A8MUM7 142 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ADH1BP00325 375 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 WNT1P04628 370 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 MPOP05164 745 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ZNF18P17022 549 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 FLT3P36888 993 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 PSMD8P48556 350 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 NUMBP49757 651 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 IRAK1P51617 712 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 JAM2P57087 298 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 KRT83P78385 493 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 SYCP1Q15431 976 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ACCSLQ4AC99 568 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 IQCHQ86VS3 1027 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 NEK11Q8NG66 645 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 HAPLN3Q96S86 360 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 MUC3BQ9H195 1237 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.61□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 A0A1W2PR77 199 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 EPHB6O15197 1021 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ATP9BO43861 1147 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 USP12O75317 370 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 IL1BP01584 269 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 RHOCP08134 193 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ALPPL2P10696 532 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 GOT1P17174 413 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 MMP8P22894 467 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 FMO1Q01740 532 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 UBXN1Q04323 297 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 STAT4Q14765 748 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 PROX2Q3B8N5 592 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 ALFQ53S48 1182 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 FRS2Q8WU20 508 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.6□□□□□ -0.07
PSME3-215ENST00000592578 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.5 ms