RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 APOL6Q9BWW8 343 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 OBP2AQ9NY56 170 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.14□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 CASTOR2A6NHX0 329 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 PPEF2O14830 753 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 TEX28O15482 410 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 TGFB1I1O43294 461 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 MBTPS2O43462 519 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 NCK2O43639 380 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 UBXN7O94888 489 aa5.13□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.13□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 PFKFB1P16118 471 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 EPCAMP16422 314 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 GAP43P17677 238 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 HK1P19367 917 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 MALP21145 153 aa5.13□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 CMA1P23946 247 aa5.13□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 CUL4BQ13620 913 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 ADALQ6DHV7 355 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF529Q6P280 563 aa5.13□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 URGCPQ8TCY9 931 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 SCFD1Q8WVM8 642 aa5.13□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 THP07101 528 aa5.12□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 MAN2A2P49641 1150 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 KRT17Q04695 432 aa5.12□□□□□ -1.59
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PRPF8-211ENST00000574728 GBX1Q14549 363 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa5.12□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PRPF8-211ENST00000574728 EFCAB13Q8IY85 973 aa5.12□□□□□ -1.59
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