RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	USP47	Q96K76	1375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	ABCC6	O95255	1503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CPLX1	O14810	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	KCNQ3	O43525	872 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	DNPH1	O43598	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	MEGF6	O75095	1541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	BEST1	O76090	585 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	ENDOD1	O94919	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	F9	P00740	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	MT-ND3	P03897	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	AMY1A	P04745	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CLEC3B	P05452	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	LAMP2	P13473	410 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	PPP3CB	P16298	524 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	KLRC1	P26715	233 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	TM4SF1	P30408	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	HOXC9	P31274	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	ABCD1	P33897	745 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	NNMT	P40261	264 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	HNF4A	P41235	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CD86	P42081	329 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CCT8	P50990	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	PDE6C	P51160	858 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	BCAT1	P54687	386 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	POLE2	P56282	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	DDR1	Q08345	913 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CTBP1	Q13363	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	BAK1	Q16611	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PCM1-223	ENST00000524356	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SOCS2	O14508	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	KRT38	O76015	456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TTLL1	O95922	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	KLRK1	P26718	216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	IL1R2	P27930	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GGT5	P36269	586 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ARL3	P36405	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PEX19	P40855	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PHKA1	P46020	1223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	PSMC6	P62333	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	UBXN1	Q04323	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	AP1B1	Q10567	949 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FHL3	Q13643	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	GPR68	Q15743	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PCM1-223	ENST00000524356		Q8NFD4	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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