RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 TCEAL1Q15170 157 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPA17Q15506 151 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM46CQ5VWP2 391 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 AFMIDQ63HM1 303 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRR23CQ6ZRP0 262 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 SYT12Q8IV01 421 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 AADATQ8N5Z0 425 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 NPWQ8N729 165 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHST14Q8NCH0 376 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSC1Q92574 1164 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 NEUROG2Q9H2A3 272 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 SGK2Q9HBY8 427 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM74BQ9NUR3 256 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PILRBQ9UKJ0 227 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 SPAG17Q6Q759 2223 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 THADAQ6YHU6 1953 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 METTL12A8MUP2 240 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 MEI4A8MW99 385 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 NDUFA10O95299 355 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 SEMA4FO95754 770 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DRD3P35462 400 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNA2P51530 1060 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARSEP51690 589 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 CARD16Q5EG05 197 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DCAF12L1Q5VU92 463 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAD9BQ6WBX8 426 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 HDDC3Q8N4P3 179 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 NETO2Q8NC67 525 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM71BQ8TC56 605 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TM6SF2Q9BZW4 377 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PCED1AQ9H1Q7 454 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 FZD4Q9ULV1 537 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TFR2Q9UP52 801 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 SDK1Q7Z5N4 2213 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 FRYLO94915 3013 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 KRT7P08729 469 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 CD48P09326 243 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 IL4RP24394 825 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DPP6P42658 865 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 MMRN1Q13201 1228 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 POM121L1PQ3SYA9 428 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 WDR45BQ5MNZ6 344 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 SYCP2LQ5T4T6 812 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TCEAL6Q6IPX3 200 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 LZTR1Q8N653 840 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMIEQ8NEW7 156 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TCEAL3Q969E4 200 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 KLHL11Q9NVR0 708 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 IL36AQ9UHA7 158 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHD5Q8TDI0 1954 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PATE3B3GLJ2 98 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 J3KR12 359 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF103O00237 685 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DFFAO00273 331 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLK4O00444 970 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRAMEF11O60813 436 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMCC1O94876 653 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 GSRP00390 522 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRNPP04156 253 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAOBP27338 520 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 DPYSL3Q14195 570 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDK2Q15119 407 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARSIQ5FYB1 569 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMCO3Q6UWJ1 677 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM139Q8IV31 216 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 TP53INP2Q8IXH6 220 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLPP6Q8IY26 295 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 RGL4Q8IZJ4 473 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 KCTD6Q8NC69 237 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM131CQ96AQ9 280 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 HEPHQ9BQS7 1158 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDFQ9HBH1 243 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms