RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SARDHQ9UL12 918 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SLC30A4O14863 429 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 DAPK3O43293 454 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CD160O95971 181 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SERPINF2P08697 491 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 TCF4P15884 667 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 IL1R2P27930 398 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CHRNA3P32297 505 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 DRD3P35462 400 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PARP15Q460N3 678 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SNX19Q92543 992 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 HMCESQ96FZ2 354 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 RTKNQ9BST9 563 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC72A6NJI9 287 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 RASA4BC9J798 803 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 RASA4O43374 803 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 DNA2P51530 1060 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF75DP51815 510 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 NDST2P52849 883 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 METAP1P53582 386 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 DPYSL2Q16555 572 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 STPG1Q5TH74 334 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 RFX8Q6ZV50 586 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CHST14Q8NCH0 376 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 BIRC7Q96CA5 298 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ZWILCHQ9H900 591 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CAPN10Q9HC96 672 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CACNA1EQ15878 2313 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1B0GTW7 788 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SLC7A4O43246 635 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 BUB1O43683 1085 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 FSBPO95073 299 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PRNPP04156 253 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CTSLP07711 333 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM253P0C7T8 217 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ERCC2P18074 760 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 HCAR3P49019 387 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ADPRHP54922 357 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SERINC3Q13530 473 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CARD16Q5EG05 197 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 TC2NQ8N9U0 490 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 TMIEQ8NEW7 156 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 TEKT4Q8WW24 435 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 HSPH1Q92598 858 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC19Q9H756 370 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 IL36AQ9UHA7 158 aa20.28■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 H3BRJ5 948 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PLK4O00444 970 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 RARAP10276 462 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ENGP17813 658 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CNTN1Q12860 1018 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ARSIQ5FYB1 569 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PLPP6Q8IY26 295 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 KLC2Q9H0B6 622 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 FSCN3Q9NQT6 498 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.27■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PROSCO94903 275 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 IGHV4-34P06331 123 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CD27P26842 260 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 ARL4AP40617 200 aa20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTPS1-206ENST00000470271 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms